2019年5月26日に、ゼニトのロシア・プレミアリーグ優勝を祝う優勝パレードがサンクトペテルブルクで開催することが決定しました。

5月19日ロシア・プレミアリーグ第29節ロストフ対ゼニトの試合が行われ、1−０でロストフが勝利しました。

5月12日ロシア・プレミアリーグ第28節ゼニト対CSKAモスクワの試合が行われ、3-1でゼニトが勝利を納めました！！

ゼニトは前節、残り3試合を残しながらも、ロシア・プレミアリーグ5度目（ソビエト連邦リーグ優勝を含めると6度目）の優勝を決定しました。そして第28節CSKAモスクワ戦（3−１でゼニトの勝利）後に優勝トロフィーの授与式が行われました。

ロシア・プレミアリーグ第27節全ての試合結果を受け、2位ロコモティフ・モスクワとの勝ち点差「９」となり、残り3試合を残しながらも、ゼニトのロシア・プレミアリーグ優勝が決定しました！！

5月4日ロシア・プレミアリーグ第27節アフマト対ゼニトの試合が行われ、1-1の引き分けに終わりました。

4月28日ロシア・プレミアリーグ第26節ゼニト対クリリヤ・ソヴェトフの試合が行われ、4-2でゼニトが勝利しました！！！

４月24日ロシア・プレミアリーグ第25節ゼニト対ディナモ・モスクワの試合が行われ、2−0でゼニトが勝利しました！！！

4月20日ロシア・プレミアリーグ第24節クラスノダール対ゼニトの試合が行われ、2−3でゼニトが勝利しました！！！

4月14日ロシア・プレミアリーグ第23節ゼニト対アンジの試合が行われ、5−０でゼニトが勝利しました！！！

4月7日ロシア・プレミアリーグ第22節ロコモティフ・モスクワ対ゼニトの試合が行われ、1−1の引き分けに終わりました。

3月31日ロシア・プレミアリーグ第21節ゼニト対オレンブルクの試合が行われ、3−1でゼニトが勝利しました！！

2018–19シーズン残り全試合の試合日程が発表されました。

ゼニト所属選手8名が各国代表チームに選出され、各代表の合宿に出発しました。

3月17日ロシア・プレミアリーグ第20節　スパルタク・モスクワ対ゼニトの試合が行われ、1−1の引き分けに終わりました。

3月14日、UEFAヨーロッパリーグラウンド16 2ndレグ　ビジャレアル対ゼニトの試合が行われ、2−1ビジャレアルが勝利。2試合合計5−2となり、ゼニトはベスト16で大会敗退となりました。

3月2日、ロシア・プレミアリーグ第18節ウラル対ゼニトの試合が行われ、0−1でゼニトが勝利を収めました！！

クラブ体制変更に伴い、ガスプロム会長アレクセイ・ミレル氏がエレーナ・イリューヒン取締役会議長、アレクサンドル・メドヴェージェフ会長、セルゲイ・フルセンコ前会長、そしてロシアサッカー協会新会長アレクサンドル・デュコフ氏と共に、ゼニトのクラブハウスを表敬訪問し、挨拶を行いました。

UEFAヨーロッパリーグラウンド16の抽選会が2月22日に行われ、ゼニトの対戦相手はスペインの強豪ビジャレアルに決まりました。

2月21日にUEFAヨーロッパリーグラウンド32 ２ndレグ　ゼニト対フェネルバフチェの試合が行われ、3−1でゼニトが勝利しました。 また2試合合計3−2でゼニトがヨーロッパリーグラウンド16に駒を進めました。